Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms