Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FAM3AP98173 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3AP98173 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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