Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTG1P63261 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms