Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP25P60880 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms