Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBASH3AP57075 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBASH3AP57075 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms