Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF10P55107 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GDF10P55107 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms