Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCR4P51679 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms