Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGIRP43119 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms