Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms