Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORAP35398 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORAP35398 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORAP35398 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms