Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms