Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB4P30926 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms