Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP5DP30049 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms