Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLD1P28340 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms