Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMBRP28336 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMBRP28336 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMBRP28336 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMBRP28336 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMBRP28336 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMBRP28336 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMBRP28336 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms