Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms