Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2AP24928 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms