Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD247P20963 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD247P20963 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD247P20963 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms