Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP4AP20648 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms