Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms