Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms