Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms