Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDPSP14324 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FDPSP14324 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FDPSP14324 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDPSP14324 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDPSP14324 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDPSP14324 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDPSP14324 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDPSP14324 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FDPSP14324 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FDPSP14324 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms