Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRF1P14222 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRF1P14222 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRF1P14222 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms