Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms