Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD3P0DMS9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms