Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C8orf88P0DMB2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C8orf88P0DMB2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms