Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms