Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSLP07711 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSLP07711 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms