Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOA1P02647 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms