Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBED1O96006 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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