Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN9O95484 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLDN9O95484 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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