Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCNDBP1O95273 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms