Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms