Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms