Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms