Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNMO15061 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms