Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms