Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms