Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms