Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBAG9O00559 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms