Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP23O00161 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP23O00161 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms