Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E9PBE3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E9PBE3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E9PBE3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms