Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms