Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms