Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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C4orf47A7E2U8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf47A7E2U8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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