Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms