Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms