Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA6BA6NDN3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6BA6NDN3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms