Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF22A3QJZ6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms